טיהור חדר ניתוח דורש חומרים עמידים, ניתנים לניקוי ועמידים בפני גידול חיידקים. חלק מחומרי הבנייה העיקריים המשמשים לטיהור חדר ניתוח כוללים:
נירוסטה: נירוסטה משמשת בדרך כלל למשטחים, משטחים וציוד בחדרי ניתוח בשל עמידותה, קלות הניקוי ועמידותה בפני קורוזיה.
ריצוף לא נקבובי: לעתים קרובות נעשה שימוש בחומרי ריצוף כגון ויניל, לינולאום או אפוקסי מכיוון שהם אינם נקבוביים, קלים לניקוי ועמידים בפני גידול חיידקים.
זְכוּכִית: ניתן להשתמש במחיצות זכוכית או בחלונות כדי לספק ראות תוך שמירה על הניקיון. זכוכית קלה לניקוי ועמידה בפני שריטות וכתמים.
צבעים אנטי-מיקרוביאליים וחיפויי קיר: קירות מכוסים בדרך כלל בצבעים אנטי-מיקרוביאליים או חומרים שקל לניקוי ועמידים בפני גידול חיידקים.
מסננים באיכות גבוהה: מערכות טיהור חדרי ניתוח כוללות לרוב מסנני אוויר איכותיים להסרת מזהמים הנישאים באוויר ושמירה על איכות האוויר.
משטחים ללא תפרים: בכל מקום אפשרי, המשטחים צריכים להיות חלקים כדי למנוע הצטברות של לכלוך וחיידקים במפרקים או סדקים.
חומרים אנטי סטטיים: בסביבות שבהן פריקה אלקטרוסטטית יכולה להוות דאגה, ניתן להשתמש בחומרים אנטי-סטטיים כדי למזער את הסיכון לנזק לציוד רגיש.
סגסוגות נחושת: כמה מחקרים העלו כי לסגסוגות נחושת יש תכונות אנטי-מיקרוביאליות אינהרנטיות, ולכן ניתן להשתמש בהן ביישומים מסוימים בחדרי ניתוח כדי לסייע בהפחתת הסיכון לזיהום.
אריחי תקרה אקוסטיים: אריחים אלו יכולים לסייע בקליטת צליל, להפחית את רמות הרעש בסביבת חדר הניתוח.
חומרים מצופים עופרת: באזורים שבהם יש צורך בהגנה מפני קרינה, ניתן להשתמש בחומרים מצופים עופרת כדי להגן מפני חשיפה לקרינה.
חומרים אלו, יחד עם נוהלי תכנון ותחזוקה נאותים, מסייעים להבטיח שחדרי ניתוח עומדים בתקנים מחמירים של ניקיון ובקרת זיהומים.